เจตจำนงสุจริต ในการบริหารงานของศูนย์ปฏิบัติการต่อต้านการทุจริต กระทรวงมหาดไทย ต่อข้าราชการ เจ้าหน้าที่ และต่อสาธารณชน เพื่อให้หน่วยงานปฏิบัติราชการโดยยึดประโยชน์ของประชาชนเป็นสำคัญ และดำเนินงานด้วยความซื่อสัตย์สุจริต มีมาตรฐานชัดเจนและอยู่ภายใต้หลักนิติธรรมเพื่อให้ประชาชนได้รับความยุติธรรมอย่างเท่าเทียมกัน และเกิดประสิทธิภาพสูงสุด คือ
1. ด้านความโปร่งใส กำหนดหลักเกณฑ์ ขั้นตอน และระยะเวลาในกระบวนการจัดซื้อจัดจ้างอย่างชัดเจน รวมถึงเปิดเผยข้อมูลเกี่ยวกับการจัดซื้อจัดจ้าง และรับฟังความคิดเห็นของประชาชนหรือผู้มีส่วนได้เสียเพื่อแก้ไขปัญหาและปรับปรุง การดำเนินงานให้มีประสิทธิภาพ
2. ด้านความพร้อมรับผิด สร้างวัฒนธรรมองค์กรที่ยึดระบบความพร้อมรับผิด และพร้อมที่จะถูกตรวจสอบ และรับผิดชอบในสิ่งที่ได้ดำเนินการ
3. ด้านความปลอดจากการทุจริตโดยจะ ไม่ยอมรับการทุจริตทุกประเภท ไม่เพิกเฉยและพร้อมที่จะดำเนินการเพื่อยับยั้งการทุจริต
4. ด้านวัฒนธรรมคุณธรรมในองค์กร ยกระดับระบบงานธุรการให้มีมาตรฐานสากลให้บริการประชาชนด้วยความซื่อสัตย์สุจริต ไม่เข้าไปมีส่วนร่วมในกิจการใดๆ อันอาจเล็งเห็นได้ว่ามีผลประโยชน์ทับซ้อน
5. ด้านคุณธรรมในการทำงานในหน่วยงาน เสริมสร้างคุณธรรม จริยธรรม และจิตสำนึกในการอำนวยความยุติธรรม รวมทั้งส่งเสริมการเป็นแบบอย่างที่ดีในการดำรงตนของบุคลากรในหน่วยงาน
6. ด้านการสื่อสารภายในหน่วยงาน ส่งเสริมและพัฒนาการสื่อสารโดยนำเทคโนโลยีที่ทันสมัยมาปรับใช้ เพื่อให้ประชาชนและบุคลากรในหน่วยงาน เข้าถึงข้อมูลข่าวสารที่เกี่ยวข้องได้โดยเปิดเผย รวดเร็ว และถูกต้อง